Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms