Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ccdc113Q8C5T8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc113Q8C5T8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ccdc113Q8C5T8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Ccdc113Q8C5T8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc113Q8C5T8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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