Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms