Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C5C9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C5C9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms