Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc90bQ8C3X2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc90bQ8C3X2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms