Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vps13cQ8BX70 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vps13cQ8BX70 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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