Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn7Q8BUM3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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