Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup54Q8BTS4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms