Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Efemp1Q8BPB5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efemp1Q8BPB5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms