Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ckap4Q8BMK4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms