Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik4Q8BMF5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms