Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp54Q8BL06 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp54Q8BL06 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms