Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms