Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rspo4Q8BJ73 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms