Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rufy1Q8BIJ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rufy1Q8BIJ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms