Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe23Q8BGW3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms