Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8BGN9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8BGN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGN9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms