Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Best2Q8BGM5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms