Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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