Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trmt12Q8BG71 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms