Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdspl2Q8BG15 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms