Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-M10.4Q85ZW8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms