Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cracr2bQ80ZJ8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms