Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IfneQ80ZF2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IfneQ80ZF2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms