Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NanogQ80Z64 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NanogQ80Z64 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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