Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrfn4Q80XU8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrfn4Q80XU8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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