Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnupnQ80W37 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms