Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Avl9Q80U56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Avl9Q80U56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms