Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo1Q7TT28 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo1Q7TT28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms