Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClmQ7TSN2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms