Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clec4b1Q7TS58 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms