Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tnfsf18Q7TS55 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tnfsf18Q7TS55 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms