Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms