Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CdsnQ7TPC1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CdsnQ7TPC1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms