Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcg2Q7TMS5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcg2Q7TMS5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms