Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms