Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms