Protein–RNA interactions for Protein: Q76MZ3

Ppp2r1a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r1aQ76MZ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2r1aQ76MZ3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2r1aQ76MZ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms