Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sned1Q70E20 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sned1Q70E20 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms