Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms