Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd3Q6ZQK0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd3Q6ZQK0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms