Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Topbp1Q6ZQF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms