Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nemp1Q6ZQE4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms