Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp34Q6ZQ93 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp34Q6ZQ93 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp34Q6ZQ93 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp34Q6ZQ93 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp34Q6ZQ93 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp34Q6ZQ93 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp34Q6ZQ93 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms