Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Glis3Q6XP49 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Glis3Q6XP49 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms