Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl3Q6W5C0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms