Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift172Q6VH22 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms