Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc88cQ6VGS5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms