Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdk2Q6V4S5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms