Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc9c1Q6UJY2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc9c1Q6UJY2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms